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Apoyo Bioinformático  
PEBC

Apoyo Bioinformático
Group Leader: PEBC



 
  RESEARCH TEAMS  
 

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Dr Manel Esteller

Grupo de Epigenética del Cáncer
 

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Dra. Montse Sanchez-Cespedes

Grupo de Genes y Cáncer
 

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Dr .Alejandro Vaquero

Grupo de Biología de la Cromatina
 

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Dr. Esteban Ballestar

Grupo de Cromatina y Enfermedad
 

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Dra. Ethel Queralt

Grupo de Ciclo Celular
 

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Dr. Dave Monk

Grupo de Impronta Genómica y Cáncer
 

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Dra. Purificación Muñoz

Grupo de Envejecimiento y Cáncer
 

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Dra. Eva Gonzalez-Suarez

Grupo de Transformación y Metástasis
 

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Dra. Maribel Parra

Grupo de Diferenciación Celular
 

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PEBC

Apoyo Bioinformático
 

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PEBC

Apoyo Genómico
 

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Dra. Silvia Barceló

Apoyo Proteómico
 

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PEBC

Servicio de Apoyo
 

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PEBC

Apoyo Administrativo a la Investigación
 
 
     
  Group description


La misión de la Unidad de Bioinformática es ofrecer apoyo y recursos de investigación cuantitativa en todos los grupos de investigación del PEBC a través de: 

 -Análisis de datos: 

 1. Arrays 

- Expresión: Agilent, Affymetrix, Nimblegen 

- Metilación: Illumina Infinium 450K, Nimblegen Chip-chip tiling arrays 

2. Next Generation Sequencing 

 - RNA-seq: Expresión diferencial y Splicing Alternativo 

- Chip-seq 

- Whole genome Bisulfite sequencing 

3. Datos provenientes de análisis proteómicos 

- Apoyo en Metodologí­a estadí­stica y en el desarrollo de nou software dependiendo del estudio 


  Leader Bio
 
Manuel Castro obtuvo su título de Biología en 2005 en la Universidad Autónoma de Barcelona (UAB). Realizó un período de investigación predoctoral hasta 2008 en el IRB en el grupo de Genes Translation. Durante este período, combinó la investigación experimental y computacional en el campo de Aminoacyl-tRNA sintetasas, centrándose en las particularidades evolutivas de algunas de estas enzimas en la biología de algunos parásitos protozoos humanos y las posibles relaciones con el proceso infeccioso. Obtuvo su Master en Bioinformática en 2012 en la Universidad Pompeu Fabra (UPF) y desde entonces hasta finales de 2015 trabajó como Jefe del Departamento de Bioinformática en la empresa privada ASCIDEA. Durante este período, lideró un equipo compuesto por bioinformáticos, programadores, profesionales de IT y desarrolladores web con el fin de proporcionar servicios de análisis bioinformático de alta calidad para datos NGS a diferentes clientes públicos y privados. Durante este período, también estuvo involucrado en el proceso de creación del CFGS en Bioinformática promovido por la asociación Bioinformatics Barcelona (BIB). Desde febrero de 2016, es miembro del PEBC y contribuye al análisis de los datos genómicos y epigenómicos de NGS y microarrays.
       
  Selected publications

 


 

  Members
NAME E-MAIL URL

María Erendira Calleja

 Investigador Postdoctoral

mcalleja@idibell.cat

Manuel Castro

 Técnico Bioinformático

mcastrod@idibell.cat

 
 

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